Continuación de clase 2

Estructura secundaria

Son estructuras tridimensionales LOCALES dentro de la secuencia polipeptídica.
De estas estructuras se destacan dos:

• Alfa hélice
  
• Hoja beta plegada

• Alfa hélice:

En esta estructura los aminoácidos se ordenan exponiendo su grupo R al exterior de la hélice, como se aprecia en el siguiente dibujo, el cual es una vista desde "arriba".

Esta conformación permite que se formen estructuras que con caracteristicas ya sea hidrofóbicas o hidrofílicas, en el caso de proteínas transmembrana por ejemplo, La sección que cruza la membrana plasmática posee grupos R que tengan características hidrofóbicas (apolares), lo cual le permite a la proteína estar inserta en la membrana plasmática.

Cada giro de la alfa helice está compuesto por 3.6 aminoácidos, los cuales están estabilizados por enlaces del tipo puente de hidrógeno.


Hoja beta plegada.

Esta es una conformación aminoácidica compuesta por una serie hebras cortas de aminoácidos (4 - 5), los cuales están unidos en una conformación plana, como se ve en la figura,

Estas hebras o cadenas interactúan entre si por medio de enlaces puente de hidrogeno, formando la estructura de "hoja".
Esta interacción puede ser con todas las cadenas en un mismo sentido "hoja beta paralela"o bien en sentidos opuestos "hoja beta antiparalela".

Estructura terciaria

Se conoce como estructura terciaria al empaquetamiento (conformación 3D) de toda la cadena polipeptídica, esta estructura es importante, ya que la estructura está fuertemente ligada a la función de la proteína.

La estructura cuaternaria

Es una asociación de subunidades, las cuales son polipéptidos que poseen un estructura terciaria determinada. Muchas proteínas están conformadas por subunidades (ejemplo: ATP sintasa), por lo cual se deduce que esta estructura tambien es muy importante para la función proteíca.